在曝氣生物濾池運行過程中，隨著運行的進行，濾料上生長的微生物膜漸漸增厚，微生物的厚度一般應控制在300μm--400μm，控制在生物膜新陳代謝能力最強，以保證出水水質最好。當微生物膜增厚超過這個范圍，曝氣生物濾池應停止運行，進行反沖洗。對于城市生活污水，一般情況下，運行24—48小時反沖洗一次（曝氣生物濾池的反沖洗周期的確定，必須根據出水水質、濾料層的水力損失，出水的濁度綜合而定）。在多格濾池并聯運行的情況下，反沖洗過程是依次單格進行。以保證整個污水處理系統不受影響而能正常運行。

反沖洗是維持曝氣生物濾池功能的關鍵，其基本要求是在較短的反沖洗時間內，使濾料得到適度的清洗，恢復濾料上的微生物膜的活性，并將濾料截留的懸浮物和老化的微生物膜沖洗出去。

操作方法：

采用先單獨用空氣進行反沖洗、再采用氣水聯合反沖洗、停止清洗30s后，再用水清洗的操作程序。對曝氣生物濾池，控制好氣、水反沖洗強度顯得尤為重要，過低達不到沖洗的目的，過高會生物膜嚴重脫落，并造成填料破損、流失。

（1）氣洗階段：關閉進水、曝氣閥門，開啟反沖洗進氣閥門，啟動反沖洗風機，進行氣洗，目的是松動濾料層，使濾料層膨脹，氣洗強度為10—15L/m2s，時間為3--5min。

（2）氣水聯合反沖洗：啟動反沖洗水泵，進行氣水聯合反沖洗，目的是將濾料上截留的懸浮物和老化的微生物沖洗出去，反沖洗水洗強度為5—6L/m2s，時間為5--8min。

（3）水漂洗：關閉反沖洗風機和反沖洗進氣閥門，進行水漂洗，目的是將濾料表面的懸浮物和老化的微生物膜沖洗出去，時間為3--5min。